Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SPEF2Q9C093 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SPEF2Q9C093 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SPEF2Q9C093 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SPEF2Q9C093 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
SPEF2Q9C093 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms