Protein–RNA interactions for Protein: Q9C091

GREB1L, GREB1-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1LQ9C091 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GREB1LQ9C091 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GREB1LQ9C091 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GREB1LQ9C091 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GREB1LQ9C091 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GREB1LQ9C091 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GREB1LQ9C091 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GREB1LQ9C091 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GREB1LQ9C091 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GREB1LQ9C091 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GREB1LQ9C091 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GREB1LQ9C091 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GREB1LQ9C091 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GREB1LQ9C091 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GREB1LQ9C091 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GREB1LQ9C091 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GREB1LQ9C091 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GREB1LQ9C091 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GREB1LQ9C091 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GREB1LQ9C091 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GREB1LQ9C091 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GREB1LQ9C091 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GREB1LQ9C091 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GREB1LQ9C091 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GREB1LQ9C091 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GREB1LQ9C091 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GREB1LQ9C091 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GREB1LQ9C091 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GREB1LQ9C091 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.3 ms