Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80BQ9C086 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80BQ9C086 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80BQ9C086 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80BQ9C086 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80BQ9C086 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80BQ9C086 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80BQ9C086 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80BQ9C086 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80BQ9C086 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
INO80BQ9C086 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INO80BQ9C086 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INO80BQ9C086 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80BQ9C086 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80BQ9C086 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80BQ9C086 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80BQ9C086 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INO80BQ9C086 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INO80BQ9C086 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80BQ9C086 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INO80BQ9C086 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
INO80BQ9C086 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
INO80BQ9C086 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
INO80BQ9C086 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms