Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NSD3Q9BZ95 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NSD3Q9BZ95 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NSD3Q9BZ95 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NSD3Q9BZ95 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NSD3Q9BZ95 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NSD3Q9BZ95 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NSD3Q9BZ95 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NSD3Q9BZ95 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NSD3Q9BZ95 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NSD3Q9BZ95 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NSD3Q9BZ95 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NSD3Q9BZ95 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NSD3Q9BZ95 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NSD3Q9BZ95 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms