Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYM8

RBCK1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1Q9BYM8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBCK1Q9BYM8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBCK1Q9BYM8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBCK1Q9BYM8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBCK1Q9BYM8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBCK1Q9BYM8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBCK1Q9BYM8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RBCK1Q9BYM8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBCK1Q9BYM8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBCK1Q9BYM8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBCK1Q9BYM8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBCK1Q9BYM8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBCK1Q9BYM8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBCK1Q9BYM8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBCK1Q9BYM8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBCK1Q9BYM8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBCK1Q9BYM8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBCK1Q9BYM8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBCK1Q9BYM8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms