Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL25A1Q9BXS0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL25A1Q9BXS0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL25A1Q9BXS0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL25A1Q9BXS0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL25A1Q9BXS0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
COL25A1Q9BXS0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL25A1Q9BXS0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL25A1Q9BXS0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL25A1Q9BXS0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL25A1Q9BXS0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL25A1Q9BXS0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL25A1Q9BXS0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL25A1Q9BXS0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL25A1Q9BXS0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL25A1Q9BXS0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL25A1Q9BXS0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms