Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA5

SUCNR1, Succinate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCNR1Q9BXA5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCNR1Q9BXA5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCNR1Q9BXA5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCNR1Q9BXA5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUCNR1Q9BXA5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUCNR1Q9BXA5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUCNR1Q9BXA5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUCNR1Q9BXA5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUCNR1Q9BXA5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUCNR1Q9BXA5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUCNR1Q9BXA5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUCNR1Q9BXA5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUCNR1Q9BXA5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUCNR1Q9BXA5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUCNR1Q9BXA5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUCNR1Q9BXA5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUCNR1Q9BXA5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUCNR1Q9BXA5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SUCNR1Q9BXA5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SUCNR1Q9BXA5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SUCNR1Q9BXA5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUCNR1Q9BXA5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUCNR1Q9BXA5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms