Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX84

TRPM6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, humanhuman

Predictions only

Length 2,022 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM6Q9BX84 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPM6Q9BX84 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPM6Q9BX84 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPM6Q9BX84 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPM6Q9BX84 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPM6Q9BX84 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPM6Q9BX84 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPM6Q9BX84 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPM6Q9BX84 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPM6Q9BX84 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPM6Q9BX84 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPM6Q9BX84 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPM6Q9BX84 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPM6Q9BX84 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPM6Q9BX84 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPM6Q9BX84 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRPM6Q9BX84 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM6Q9BX84 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM6Q9BX84 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM6Q9BX84 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPM6Q9BX84 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM6Q9BX84 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM6Q9BX84 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM6Q9BX84 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPM6Q9BX84 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPM6Q9BX84 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms