Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LSM14BQ9BX40 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LSM14BQ9BX40 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LSM14BQ9BX40 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LSM14BQ9BX40 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms