Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSBP3Q9BWW4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSBP3Q9BWW4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSBP3Q9BWW4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms