Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF2Q9BWQ6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YIPF2Q9BWQ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YIPF2Q9BWQ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YIPF2Q9BWQ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YIPF2Q9BWQ6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF2Q9BWQ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YIPF2Q9BWQ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YIPF2Q9BWQ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YIPF2Q9BWQ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF2Q9BWQ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF2Q9BWQ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF2Q9BWQ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF2Q9BWQ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF2Q9BWQ6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YIPF2Q9BWQ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF2Q9BWQ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF2Q9BWQ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms