Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC11Q9BVV2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC11Q9BVV2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNDC11Q9BVV2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNDC11Q9BVV2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNDC11Q9BVV2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNDC11Q9BVV2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNDC11Q9BVV2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FNDC11Q9BVV2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNDC11Q9BVV2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms