Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTDSS2Q9BVG9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTDSS2Q9BVG9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTDSS2Q9BVG9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTDSS2Q9BVG9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTDSS2Q9BVG9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTDSS2Q9BVG9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTDSS2Q9BVG9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1968.8 ms