Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF4Q9BUZ4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF4Q9BUZ4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms