Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFJQ9BTM1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
H2AFJQ9BTM1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2AFJQ9BTM1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms