Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDHD3Q9BSH5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HDHD3Q9BSH5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HDHD3Q9BSH5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDHD3Q9BSH5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms