Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIPSNAP3BQ9BS92 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NIPSNAP3BQ9BS92 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NIPSNAP3BQ9BS92 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms