Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A3Q9BRY0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A3Q9BRY0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC39A3Q9BRY0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC39A3Q9BRY0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC39A3Q9BRY0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms