Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GINS3Q9BRX5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GINS3Q9BRX5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS3Q9BRX5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.9 ms