Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP9

Putative uncharacterized protein MGC13053, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9BRP9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9BRP9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9BRP9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9BRP9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9BRP9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9BRP9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9BRP9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9BRP9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9BRP9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9BRP9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9BRP9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9BRP9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9BRP9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9BRP9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9BRP9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9BRP9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9BRP9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9BRP9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9BRP9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9BRP9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9BRP9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9BRP9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9BRP9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9BRP9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9BRP9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9BRP9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9BRP9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9BRP9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9BRP9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9BRP9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9BRP9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9BRP9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9BRP9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9BRP9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9BRP9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9BRP9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9BRP9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9BRP9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9BRP9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9BRP9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9BRP9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9BRP9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9BRP9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9BRP9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9BRP9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9BRP9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9BRP9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9BRP9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9BRP9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9BRP9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9BRP9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9BRP9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9BRP9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9BRP9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9BRP9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9BRP9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9BRP9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9BRP9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9BRP9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9BRP9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9BRP9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9BRP9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9BRP9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9BRP9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9BRP9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9BRP9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9BRP9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9BRP9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9BRP9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9BRP9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9BRP9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9BRP9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9BRP9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9BRP9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9BRP9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9BRP9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9BRP9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9BRP9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9BRP9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9BRP9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9BRP9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9BRP9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9BRP9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9BRP9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9BRP9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9BRP9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9BRP9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9BRP9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9BRP9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9BRP9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9BRP9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9BRP9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9BRP9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9BRP9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9BRP9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9BRP9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9BRP9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9BRP9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9BRP9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9BRP9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms