Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MESP1Q9BRJ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MESP1Q9BRJ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MESP1Q9BRJ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MESP1Q9BRJ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MESP1Q9BRJ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MESP1Q9BRJ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MESP1Q9BRJ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MESP1Q9BRJ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MESP1Q9BRJ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MESP1Q9BRJ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MESP1Q9BRJ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MESP1Q9BRJ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MESP1Q9BRJ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MESP1Q9BRJ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MESP1Q9BRJ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MESP1Q9BRJ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms