Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS25Q9BRG1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS25Q9BRG1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS25Q9BRG1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms