Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPPED1Q9BRF8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CPPED1Q9BRF8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPPED1Q9BRF8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPPED1Q9BRF8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPPED1Q9BRF8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPPED1Q9BRF8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPPED1Q9BRF8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CPPED1Q9BRF8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPPED1Q9BRF8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPPED1Q9BRF8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPPED1Q9BRF8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPPED1Q9BRF8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPPED1Q9BRF8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPPED1Q9BRF8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPPED1Q9BRF8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPPED1Q9BRF8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPPED1Q9BRF8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPPED1Q9BRF8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms