Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMCHL2Q9BQD1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMCHL2Q9BQD1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PMCHL2Q9BQD1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PMCHL2Q9BQD1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms