Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Rrbp1Q99PL5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Rrbp1Q99PL5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rrbp1Q99PL5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rrbp1Q99PL5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Rrbp1Q99PL5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rrbp1Q99PL5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rrbp1Q99PL5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rrbp1Q99PL5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Rrbp1Q99PL5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rrbp1Q99PL5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rrbp1Q99PL5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rrbp1Q99PL5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rrbp1Q99PL5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Rrbp1Q99PL5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rrbp1Q99PL5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rrbp1Q99PL5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rrbp1Q99PL5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rrbp1Q99PL5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rrbp1Q99PL5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rrbp1Q99PL5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rrbp1Q99PL5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Rrbp1Q99PL5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rrbp1Q99PL5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rrbp1Q99PL5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rrbp1Q99PL5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rrbp1Q99PL5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Rrbp1Q99PL5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Rrbp1Q99PL5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rrbp1Q99PL5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Rrbp1Q99PL5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rrbp1Q99PL5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rrbp1Q99PL5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rrbp1Q99PL5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rrbp1Q99PL5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rrbp1Q99PL5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rrbp1Q99PL5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Rrbp1Q99PL5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rrbp1Q99PL5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rrbp1Q99PL5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rrbp1Q99PL5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Rrbp1Q99PL5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Rrbp1Q99PL5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rrbp1Q99PL5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rrbp1Q99PL5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rrbp1Q99PL5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rrbp1Q99PL5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rrbp1Q99PL5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rrbp1Q99PL5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rrbp1Q99PL5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rrbp1Q99PL5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.95■■■■□ 3.5
Rrbp1Q99PL5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Rrbp1Q99PL5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rrbp1Q99PL5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rrbp1Q99PL5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rrbp1Q99PL5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Rrbp1Q99PL5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rrbp1Q99PL5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Rrbp1Q99PL5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rrbp1Q99PL5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Rrbp1Q99PL5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rrbp1Q99PL5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Rrbp1Q99PL5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rrbp1Q99PL5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rrbp1Q99PL5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rrbp1Q99PL5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rrbp1Q99PL5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Rrbp1Q99PL5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rrbp1Q99PL5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rrbp1Q99PL5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rrbp1Q99PL5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rrbp1Q99PL5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rrbp1Q99PL5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rrbp1Q99PL5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rrbp1Q99PL5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rrbp1Q99PL5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rrbp1Q99PL5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Rrbp1Q99PL5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Rrbp1Q99PL5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Rrbp1Q99PL5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rrbp1Q99PL5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms