Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim3Q99PE5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Smim3Q99PE5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smim3Q99PE5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim3Q99PE5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms