Protein–RNA interactions for Protein: Q99PB1

1700020D05Rik, Mage-g2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700020D05RikQ99PB1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700020D05RikQ99PB1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700020D05RikQ99PB1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700020D05RikQ99PB1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700020D05RikQ99PB1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
1700020D05RikQ99PB1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700020D05RikQ99PB1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700020D05RikQ99PB1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700020D05RikQ99PB1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700020D05RikQ99PB1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700020D05RikQ99PB1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700020D05RikQ99PB1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700020D05RikQ99PB1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700020D05RikQ99PB1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700020D05RikQ99PB1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700020D05RikQ99PB1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700020D05RikQ99PB1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700020D05RikQ99PB1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700020D05RikQ99PB1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700020D05RikQ99PB1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700020D05RikQ99PB1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700020D05RikQ99PB1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700020D05RikQ99PB1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700020D05RikQ99PB1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700020D05RikQ99PB1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700020D05RikQ99PB1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700020D05RikQ99PB1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700020D05RikQ99PB1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700020D05RikQ99PB1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700020D05RikQ99PB1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700020D05RikQ99PB1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700020D05RikQ99PB1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
1700020D05RikQ99PB1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700020D05RikQ99PB1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
1700020D05RikQ99PB1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700020D05RikQ99PB1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700020D05RikQ99PB1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms