Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab27bQ99P58 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab27bQ99P58 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab27bQ99P58 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab27bQ99P58 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rab27bQ99P58 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab27bQ99P58 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab27bQ99P58 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab27bQ99P58 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms