Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac9Q99N13 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac9Q99N13 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hdac9Q99N13 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Hdac9Q99N13 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac9Q99N13 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac9Q99N13 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac9Q99N13 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac9Q99N13 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hdac9Q99N13 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hdac9Q99N13 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hdac9Q99N13 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hdac9Q99N13 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hdac9Q99N13 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac9Q99N13 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac9Q99N13 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hdac9Q99N13 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hdac9Q99N13 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Hdac9Q99N13 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac9Q99N13 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac9Q99N13 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hdac9Q99N13 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hdac9Q99N13 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hdac9Q99N13 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac9Q99N13 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac9Q99N13 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac9Q99N13 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac9Q99N13 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac9Q99N13 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac9Q99N13 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac9Q99N13 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms