Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rnf17Q99MV7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rnf17Q99MV7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rnf17Q99MV7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rnf17Q99MV7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
Rnf17Q99MV7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rnf17Q99MV7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rnf17Q99MV7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rnf17Q99MV7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rnf17Q99MV7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rnf17Q99MV7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rnf17Q99MV7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rnf17Q99MV7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rnf17Q99MV7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rnf17Q99MV7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Rnf17Q99MV7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Rnf17Q99MV7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rnf17Q99MV7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rnf17Q99MV7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rnf17Q99MV7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rnf17Q99MV7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Rnf17Q99MV7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rnf17Q99MV7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rnf17Q99MV7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rnf17Q99MV7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rnf17Q99MV7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rnf17Q99MV7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rnf17Q99MV7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Rnf17Q99MV7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rnf17Q99MV7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rnf17Q99MV7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rnf17Q99MV7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Rnf17Q99MV7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rnf17Q99MV7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rnf17Q99MV7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rnf17Q99MV7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Rnf17Q99MV7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rnf17Q99MV7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rnf17Q99MV7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rnf17Q99MV7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rnf17Q99MV7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rnf17Q99MV7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rnf17Q99MV7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rnf17Q99MV7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rnf17Q99MV7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Rnf17Q99MV7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rnf17Q99MV7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rnf17Q99MV7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rnf17Q99MV7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rnf17Q99MV7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rnf17Q99MV7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rnf17Q99MV7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rnf17Q99MV7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rnf17Q99MV7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rnf17Q99MV7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rnf17Q99MV7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Rnf17Q99MV7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rnf17Q99MV7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Rnf17Q99MV7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rnf17Q99MV7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rnf17Q99MV7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rnf17Q99MV7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rnf17Q99MV7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rnf17Q99MV7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rnf17Q99MV7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rnf17Q99MV7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rnf17Q99MV7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rnf17Q99MV7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Rnf17Q99MV7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rnf17Q99MV7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rnf17Q99MV7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Rnf17Q99MV7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rnf17Q99MV7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rnf17Q99MV7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rnf17Q99MV7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rnf17Q99MV7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Rnf17Q99MV7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rnf17Q99MV7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rnf17Q99MV7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rnf17Q99MV7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rnf17Q99MV7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rnf17Q99MV7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rnf17Q99MV7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rnf17Q99MV7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rnf17Q99MV7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rnf17Q99MV7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Rnf17Q99MV7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Rnf17Q99MV7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rnf17Q99MV7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rnf17Q99MV7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rnf17Q99MV7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rnf17Q99MV7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rnf17Q99MV7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rnf17Q99MV7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rnf17Q99MV7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rnf17Q99MV7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rnf17Q99MV7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Rnf17Q99MV7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rnf17Q99MV7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rnf17Q99MV7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms