Protein–RNA interactions for Protein: Q99MT2

Msh4, MutS protein homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh4Q99MT2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh4Q99MT2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Msh4Q99MT2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Msh4Q99MT2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msh4Q99MT2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msh4Q99MT2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh4Q99MT2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.6 ms