Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed9Q99KF1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tmed9Q99KF1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmed9Q99KF1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmed9Q99KF1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmed9Q99KF1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms