Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Me2Q99KE1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Me2Q99KE1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me2Q99KE1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me2Q99KE1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me2Q99KE1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me2Q99KE1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me2Q99KE1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me2Q99KE1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Me2Q99KE1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Me2Q99KE1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Me2Q99KE1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Me2Q99KE1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Me2Q99KE1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Me2Q99KE1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Me2Q99KE1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Me2Q99KE1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Me2Q99KE1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Me2Q99KE1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Me2Q99KE1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Me2Q99KE1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Me2Q99KE1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Me2Q99KE1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Me2Q99KE1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Me2Q99KE1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Me2Q99KE1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Me2Q99KE1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Me2Q99KE1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Me2Q99KE1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Me2Q99KE1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Me2Q99KE1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Me2Q99KE1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Me2Q99KE1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Me2Q99KE1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Me2Q99KE1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Me2Q99KE1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Me2Q99KE1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Me2Q99KE1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Me2Q99KE1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Me2Q99KE1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Me2Q99KE1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Me2Q99KE1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Me2Q99KE1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Me2Q99KE1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Me2Q99KE1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Me2Q99KE1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Me2Q99KE1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Me2Q99KE1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Me2Q99KE1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Me2Q99KE1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Me2Q99KE1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Me2Q99KE1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms