Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdxdc1Q99K01 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdxdc1Q99K01 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdxdc1Q99K01 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdxdc1Q99K01 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdxdc1Q99K01 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pdxdc1Q99K01 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdxdc1Q99K01 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdxdc1Q99K01 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdxdc1Q99K01 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdxdc1Q99K01 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdxdc1Q99K01 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms