Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3GL3Q99963 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3GL3Q99963 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3GL3Q99963 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3GL3Q99963 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3GL3Q99963 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms