Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AGPAT1Q99943 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
AGPAT1Q99943 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AGPAT1Q99943 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGPAT1Q99943 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGPAT1Q99943 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGPAT1Q99943 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGPAT1Q99943 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGPAT1Q99943 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGPAT1Q99943 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AGPAT1Q99943 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AGPAT1Q99943 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AGPAT1Q99943 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
AGPAT1Q99943 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
AGPAT1Q99943 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AGPAT1Q99943 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms