Protein–RNA interactions for Protein: Q96T68

SETDB2, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB2Q96T68 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SETDB2Q96T68 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SETDB2Q96T68 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SETDB2Q96T68 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SETDB2Q96T68 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SETDB2Q96T68 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SETDB2Q96T68 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SETDB2Q96T68 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SETDB2Q96T68 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SETDB2Q96T68 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SETDB2Q96T68 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SETDB2Q96T68 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SETDB2Q96T68 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SETDB2Q96T68 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SETDB2Q96T68 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SETDB2Q96T68 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SETDB2Q96T68 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SETDB2Q96T68 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SETDB2Q96T68 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SETDB2Q96T68 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SETDB2Q96T68 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SETDB2Q96T68 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SETDB2Q96T68 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SETDB2Q96T68 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SETDB2Q96T68 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SETDB2Q96T68 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SETDB2Q96T68 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SETDB2Q96T68 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SETDB2Q96T68 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SETDB2Q96T68 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SETDB2Q96T68 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SETDB2Q96T68 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SETDB2Q96T68 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SETDB2Q96T68 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SETDB2Q96T68 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SETDB2Q96T68 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SETDB2Q96T68 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SETDB2Q96T68 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SETDB2Q96T68 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SETDB2Q96T68 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SETDB2Q96T68 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SETDB2Q96T68 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms