Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUFY1Q96T51 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY1Q96T51 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY1Q96T51 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY1Q96T51 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY1Q96T51 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY1Q96T51 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY1Q96T51 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY1Q96T51 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY1Q96T51 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY1Q96T51 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY1Q96T51 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY1Q96T51 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY1Q96T51 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY1Q96T51 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY1Q96T51 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY1Q96T51 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY1Q96T51 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RUFY1Q96T51 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RUFY1Q96T51 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms