Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SIN3AQ96ST3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SIN3AQ96ST3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SIN3AQ96ST3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SIN3AQ96ST3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
SIN3AQ96ST3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SIN3AQ96ST3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SIN3AQ96ST3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
SIN3AQ96ST3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SIN3AQ96ST3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SIN3AQ96ST3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SIN3AQ96ST3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SIN3AQ96ST3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SIN3AQ96ST3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SIN3AQ96ST3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SIN3AQ96ST3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SIN3AQ96ST3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SIN3AQ96ST3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SIN3AQ96ST3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SIN3AQ96ST3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SIN3AQ96ST3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SIN3AQ96ST3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SIN3AQ96ST3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SIN3AQ96ST3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SIN3AQ96ST3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SIN3AQ96ST3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SIN3AQ96ST3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SIN3AQ96ST3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SIN3AQ96ST3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SIN3AQ96ST3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SIN3AQ96ST3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SIN3AQ96ST3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SIN3AQ96ST3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms