Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSPAN18Q96SJ8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSPAN18Q96SJ8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSPAN18Q96SJ8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSPAN18Q96SJ8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSPAN18Q96SJ8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSPAN18Q96SJ8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN18Q96SJ8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN18Q96SJ8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN18Q96SJ8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN18Q96SJ8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN18Q96SJ8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN18Q96SJ8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN18Q96SJ8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN18Q96SJ8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TSPAN18Q96SJ8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSPAN18Q96SJ8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSPAN18Q96SJ8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSPAN18Q96SJ8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSPAN18Q96SJ8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSPAN18Q96SJ8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSPAN18Q96SJ8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSPAN18Q96SJ8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms