Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ALS2CR12Q96Q35 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2CR12Q96Q35 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALS2CR12Q96Q35 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2CR12Q96Q35 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2CR12Q96Q35 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2CR12Q96Q35 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2CR12Q96Q35 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2CR12Q96Q35 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2CR12Q96Q35 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2CR12Q96Q35 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2CR12Q96Q35 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2CR12Q96Q35 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2CR12Q96Q35 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2CR12Q96Q35 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2CR12Q96Q35 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALS2CR12Q96Q35 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2CR12Q96Q35 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms