Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PLIN4Q96Q06 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PLIN4Q96Q06 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PLIN4Q96Q06 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PLIN4Q96Q06 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PLIN4Q96Q06 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PLIN4Q96Q06 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PLIN4Q96Q06 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PLIN4Q96Q06 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PLIN4Q96Q06 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PLIN4Q96Q06 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PLIN4Q96Q06 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PLIN4Q96Q06 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PLIN4Q96Q06 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PLIN4Q96Q06 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PLIN4Q96Q06 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PLIN4Q96Q06 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PLIN4Q96Q06 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLIN4Q96Q06 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms