Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC85AQ96PX6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC85AQ96PX6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC85AQ96PX6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC85AQ96PX6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC85AQ96PX6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC85AQ96PX6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC85AQ96PX6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC85AQ96PX6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC85AQ96PX6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC85AQ96PX6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC85AQ96PX6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC85AQ96PX6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC85AQ96PX6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC85AQ96PX6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC85AQ96PX6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms