Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SORCS2Q96PQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SORCS2Q96PQ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SORCS2Q96PQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORCS2Q96PQ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms