Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCGB3A2Q96PL1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCGB3A2Q96PL1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCGB3A2Q96PL1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCGB3A2Q96PL1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCGB3A2Q96PL1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCGB3A2Q96PL1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCGB3A2Q96PL1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCGB3A2Q96PL1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCGB3A2Q96PL1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB3A2Q96PL1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB3A2Q96PL1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCGB3A2Q96PL1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCGB3A2Q96PL1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCGB3A2Q96PL1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCGB3A2Q96PL1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms