Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPRD1AQ96P16 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPRD1AQ96P16 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPRD1AQ96P16 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPRD1AQ96P16 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms