Protein–RNA interactions for Protein: Q96N58

ZNF578, Zinc finger protein 578, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF578Q96N58 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF578Q96N58 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF578Q96N58 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF578Q96N58 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF578Q96N58 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF578Q96N58 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF578Q96N58 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF578Q96N58 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF578Q96N58 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF578Q96N58 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF578Q96N58 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF578Q96N58 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF578Q96N58 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF578Q96N58 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF578Q96N58 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF578Q96N58 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF578Q96N58 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF578Q96N58 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF578Q96N58 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF578Q96N58 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms