Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00167Q96N53 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00167Q96N53 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00167Q96N53 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms