Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC74BQ96LY2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC74BQ96LY2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC74BQ96LY2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC74BQ96LY2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC74BQ96LY2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC74BQ96LY2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC74BQ96LY2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC74BQ96LY2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms