Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNPC3Q96LT9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNPC3Q96LT9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNPC3Q96LT9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNPC3Q96LT9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNPC3Q96LT9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNPC3Q96LT9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNPC3Q96LT9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNPC3Q96LT9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNPC3Q96LT9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNPC3Q96LT9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNPC3Q96LT9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNPC3Q96LT9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNPC3Q96LT9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNPC3Q96LT9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNPC3Q96LT9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNPC3Q96LT9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNPC3Q96LT9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNPC3Q96LT9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNPC3Q96LT9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNPC3Q96LT9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNPC3Q96LT9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNPC3Q96LT9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNPC3Q96LT9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNPC3Q96LT9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNPC3Q96LT9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNPC3Q96LT9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNPC3Q96LT9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNPC3Q96LT9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNPC3Q96LT9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RNPC3Q96LT9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNPC3Q96LT9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNPC3Q96LT9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms